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小鼠微生物檢測

原創發布者:北檢院    發布時間:2025-04-09     點擊數:

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注意:因業務調整,暫不接受個人委托測試望見諒。

小鼠腸道微生物組檢測分析報告

檢測樣品

本次檢測的樣品為健康成年C57BL/6小鼠的腸道內容物與糞便樣本,共包含3組實驗組與1組對照組,每組5只小鼠。所有樣本均通過無菌操作采集,并于-80℃超低溫冰箱中保存,避免微生物活性與DNA降解。

檢測項目

  1. 腸道菌群多樣性分析:包括α多樣性(物種豐度與均勻度)與β多樣性(組間差異分析)。
  2. 核心菌群組成檢測:鑒定門、綱、目、科、屬、種水平的微生物分類。
  3. 潛在致病菌篩查:針對沙門氏菌、大腸桿菌、幽門螺桿菌等常見致病菌進行特異性檢測。
  4. 功能基因預測:基于宏基因組學分析微生物代謝通路與功能潛能。

檢測方法

  1. DNA提取與純化 使用QIAamp® DNA Stool Mini Kit(Qiagen)對樣本進行微生物總DNA提取,通過瓊脂糖凝膠電泳與NanoDrop分光光度計檢測DNA濃度與完整性。

  2. 16S rRNA基因擴增與測序 針對細菌16S rRNA基因V3-V4高變區設計引物(341F/806R),通過PCR擴增后構建文庫,采用Illumina NovaSeq 6000平臺進行高通量雙端測序(PE250)。

  3. 生物信息學分析 原始數據經質控(Trimmomatic過濾低質量序列)后,使用QIIME2分析流程進行物種注釋(基于SILVA數據庫)與多樣性計算;致病菌檢測通過BLAST比對NCBI病原菌數據庫完成。

  4. 統計與可視化 采用R語言(vegan包)進行組間差異顯著性檢驗,結果通過LEfSe分析篩選標志性物種,并使用Heatmap、PCA圖等形式展示。

檢測儀器

  1. 核酸提取與定量

    • 離心機:Eppendorf Centrifuge 5424 R
    • 分光光度計:Thermo Scientific NanoDrop 2000
  2. PCR擴增與文庫構建

    • PCR儀:Bio-Rad T100 Thermal Cycler
    • 自動化工作站:Beckman Coulter Biomek 4000
  3. 高通量測序

    • 測序平臺:Illumina NovaSeq 6000
  4. 數據分析

    • 高性能計算集群:DELL PowerEdge R740(Linux系統)

結語

本研究通過多組學技術系統解析了小鼠腸道微生物的組成與功能特征,為后續研究菌群與宿主健康的關聯提供了數據支持。標準化實驗流程與高精度儀器的結合,確保了檢測結果的可靠性與重復性。未來可進一步結合代謝組學,深入探究微生物代謝產物對宿主的調控機制。

(本文為模擬分析報告,實際實驗需根據具體需求調整方案。)

實驗儀器

實驗室儀器 實驗室儀器 實驗室儀器 實驗室儀器

測試流程

小鼠微生物檢測流程

注意事項

1.具體的試驗周期以工程師告知的為準。

2.文章中的圖片或者標準以及具體的試驗方案僅供參考,因為每個樣品和項目都有所不同,所以最終以工程師告知的為準。

3.關于(樣品量)的需求,最好是先咨詢我們的工程師確定,避免不必要的樣品損失。

4.加急試驗周期一般是五個工作日左右,部分樣品有所差異

5.如果對于(小鼠微生物檢測)還有什么疑問,可以咨詢我們的工程師為您一一解答。

  • 服務保障 一對一品質服務
  • 定制方案 提供非標定制試驗方案
  • 保密協議 簽訂保密協議,嚴格保護客戶隱私
  • 全國取樣/寄樣 全國上門取樣/寄樣/現場試驗
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