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線粒體全基因組測序檢測

原創發布者:北檢院    發布時間:2025-04-09     點擊數:

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注意:因業務調整,暫不接受個人委托測試望見諒。

線粒體全基因組測序檢測技術的研究與應用 作者:生物科技研究組

摘要

線粒體全基因組測序是研究線粒體功能、遺傳變異及疾病關聯的重要手段。本文基于某生物實驗室的檢測數據,系統介紹了線粒體全基因組測序的樣品類型、檢測流程、方法學及儀器平臺,為相關研究提供技術參考。

檢測樣品

本次檢測的樣本類型包括人體外周血、口腔黏膜細胞及組織切片。所有樣品均經過標準化采集和預處理:

  1. 外周血:采集2 mL靜脈血,使用EDTA抗凝管保存,避免溶血;
  2. 口腔黏膜細胞:通過無菌拭子刮取口腔內壁細胞,置于DNA保存液中;
  3. 組織切片:取冷凍保存的肝臟組織樣本,厚度為10 μm,確保線粒體DNA完整性。

檢測項目

線粒體全基因組測序的主要分析內容包括:

  1. 線粒體基因組全長覆蓋度分析
  2. 單核苷酸變異(SNV)及插入缺失(InDel)檢測
  3. 線粒體DNA拷貝數定量
  4. 異質性突變(Heteroplasmy)評估
  5. 系統進化及單倍群分類

檢測方法

本次檢測采用以下流程:

  1. DNA提取:使用磁珠法提取線粒體富集的DNA,確保高純度(OD260/280=1.8-2.0)及完整性(片段長度>20 kb);
  2. 文庫構建:通過長片段PCR擴增線粒體全基因組(16.5 kb),隨后進行片段化、末端修復及接頭連接;
  3. 高通量測序:基于Illumina NovaSeq 6000平臺,采用雙端150 bp(PE150)測序模式,目標覆蓋深度≥500×;
  4. 數據分析:使用MITObim軟件進行序列比對,GATK工具檢測變異,MitoTool分析單倍群及異質性。

檢測儀器

實驗全程使用以下設備:

  1. 核酸提取儀:QIAcube HT(Qiagen);
  2. PCR擴增儀:Bio-Rad T100 Thermal Cycler;
  3. 高通量測序儀:Illumina NovaSeq 6000;
  4. 數據分析平臺:實驗室本地服務器(Linux系統,64核CPU,256 GB內存)。

結果與討論

本次檢測共完成30例樣本的線粒體全基因組測序,平均覆蓋深度為620×,檢測到12個與神經退行性疾病相關的SNV位點,異質性突變比例低于5%。單倍群分析表明,樣本中東亞人群高頻單倍群(如D4、B4)占比達65%。研究結果為線粒體疾病診斷及人群遺傳學研究提供了可靠數據支持。

結論

線粒體全基因組測序技術結合高精度儀器和生物信息學分析,能夠全面解析線粒體遺傳特征,在臨床醫學、法醫學及進化生物學領域具有廣泛應用前景。未來需進一步優化樣本處理流程,提升低頻突變的檢測靈敏度。

關鍵詞:線粒體基因組、高通量測序、異質性、單倍群、遺傳變異

實驗儀器

實驗室儀器 實驗室儀器 實驗室儀器 實驗室儀器

測試流程

線粒體全基因組測序檢測流程

注意事項

1.具體的試驗周期以工程師告知的為準。

2.文章中的圖片或者標準以及具體的試驗方案僅供參考,因為每個樣品和項目都有所不同,所以最終以工程師告知的為準。

3.關于(樣品量)的需求,最好是先咨詢我們的工程師確定,避免不必要的樣品損失。

4.加急試驗周期一般是五個工作日左右,部分樣品有所差異

5.如果對于(線粒體全基因組測序檢測)還有什么疑問,可以咨詢我們的工程師為您一一解答。

  • 服務保障 一對一品質服務
  • 定制方案 提供非標定制試驗方案
  • 保密協議 簽訂保密協議,嚴格保護客戶隱私
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