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全基因組轉錄組檢測

原創發布者:北檢院    發布時間:2025-04-09     點擊數:

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注意:因業務調整,暫不接受個人委托測試望見諒。

全基因組轉錄組檢測技術解析與應用

一、檢測樣品 全基因組轉錄組檢測適用于多種生物樣本,包括但不限于動植物組織、細胞培養物、血液、唾液及微生物樣本。樣品需滿足高質量RNA提取要求,建議使用新鮮樣本或經液氮速凍后保存于-80℃的樣本,避免反復凍融。運輸過程中需采用干冰或低溫冷鏈,確保RNA完整性。

二、檢測項目

  1. 基因表達譜分析:全面檢測樣本中所有基因的表達水平,揭示基因在不同生理或病理狀態下的調控模式。
  2. 差異表達基因篩選:通過組間對比,識別顯著上調和下調的基因,挖掘潛在生物標志物。
  3. 功能富集分析:對差異基因進行GO(基因本體)和KEGG(京都基因與基因組百科全書)通路分析,解析生物學功能。
  4. 可變剪切事件檢測:識別轉錄本的可變剪切形式,探索基因表達的復雜性。
  5. 非編碼RNA分析:涵蓋miRNA、lncRNA等非編碼RNA的表達與功能研究。

三、檢測方法

  1. RNA提取與質控 采用TRIzol法或磁珠法提取總RNA,通過Agilent 2100生物分析儀檢測RNA完整性(RIN值≥7),并使用Qubit熒光定量儀測定濃度。
  2. 文庫構建 利用Illumina TruSeq Stranded mRNA建庫試劑盒,完成mRNA富集、片段化、逆轉錄及雙端接頭連接,構建高通量測序文庫。
  3. 高通量測序 基于Illumina NovaSeq 6000平臺進行雙端測序(PE150),單樣本數據量≥6 Gb,確保基因覆蓋深度。
  4. 數據分析 原始數據經質控過濾后,使用HISAT2比對參考基因組,StringTie進行轉錄本組裝,DESeq2分析差異表達,ClusterProfiler完成功能注釋。

四、檢測儀器

  1. Agilent 2100生物分析儀:用于RNA完整性檢測,確保樣本符合測序要求。
  2. Illumina NovaSeq 6000:高通量測序核心設備,支持大規模并行測序。
  3. Qubit 4.0熒光定量儀:精準測定RNA濃度,避免傳統分光光度法的干擾。
  4. 高性能計算集群:搭載生物信息分析軟件(如TopHat、Cufflinks),完成數據挖掘與可視化。

五、技術優勢與應用場景 全基因組轉錄組檢測可全面解析基因表達動態,廣泛應用于疾病機制研究(如癌癥、神經退行性疾病)、藥物靶點篩選、農業育種及環境脅迫響應等領域。其高靈敏度與高分辨率特性,為精準醫學和分子生物學研究提供關鍵數據支撐。

結語 隨著測序成本的降低和生物信息學工具的完善,全基因組轉錄組檢測已成為生命科學研究的常規手段。通過標準化實驗流程與智能化數據分析,該技術將持續推動基礎研究與臨床轉化的深度融合。

實驗儀器

實驗室儀器 實驗室儀器 實驗室儀器 實驗室儀器

測試流程

全基因組轉錄組檢測流程

注意事項

1.具體的試驗周期以工程師告知的為準。

2.文章中的圖片或者標準以及具體的試驗方案僅供參考,因為每個樣品和項目都有所不同,所以最終以工程師告知的為準。

3.關于(樣品量)的需求,最好是先咨詢我們的工程師確定,避免不必要的樣品損失。

4.加急試驗周期一般是五個工作日左右,部分樣品有所差異

5.如果對于(全基因組轉錄組檢測)還有什么疑問,可以咨詢我們的工程師為您一一解答。

  • 服務保障 一對一品質服務
  • 定制方案 提供非標定制試驗方案
  • 保密協議 簽訂保密協議,嚴格保護客戶隱私
  • 全國取樣/寄樣 全國上門取樣/寄樣/現場試驗
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