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NGS檢測的判斷檢測標準

原創發布者:北檢院    發布時間:2025-04-25     點擊數:

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NGS檢測技術:標準化流程與核心要素解析

新一代測序技術(Next-Generation Sequencing, NGS)憑借其高通量、高精度的特點,已成為現代醫學與生命科學研究的核心工具。為確保檢測結果的可靠性與臨床適用性,需嚴格遵循標準化的檢測流程。以下從檢測樣品、項目、方法及儀器等方面,系統闡述NGS檢測的關鍵環節。

一、檢測樣品類型

NGS檢測的適用樣本范圍廣泛,主要包括:

  • 臨床樣本:血液、組織活檢樣本(如腫瘤組織)、體液(如胸腹水)以及口腔拭子等。
  • 特殊樣本:福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織、游離DNA(cfDNA)及單細胞樣本。 所有樣本需符合預處理標準,例如血液樣本需使用EDTA抗凝管保存,組織樣本需在-80℃超低溫或特定固定液中儲存,運輸過程需嚴格控溫以避免核酸降解。

二、檢測項目分類

根據應用場景,NGS檢測主要覆蓋以下領域:

  1. 腫瘤基因檢測 涵蓋實體瘤和血液腫瘤的驅動基因突變(如EGFR、KRAS)、融合基因(如ALK、ROS1)及微衛星不穩定性(MSI)分析,為靶向治療和免疫治療提供依據。
  2. 遺傳病篩查 針對單基因遺傳病(如地中海貧血、遺傳性耳聾)和多基因疾病(如心血管疾病)的致病性變異檢測。
  3. 病原微生物檢測 通過宏基因組測序(mNGS)快速鑒定細菌、病毒、真菌及寄生蟲等病原體,輔助感染性疾病診斷。
  4. 藥物基因組學 解析藥物代謝相關基因(如CYP2C19、HLA-B*5801)的多態性,指導個體化用藥。

三、檢測方法標準化流程

NGS檢測需通過以下關鍵步驟完成: 1. 核酸提取與質控 使用磁珠法或離心柱法提取DNA/RNA,并通過分光光度計(如Nanodrop)或熒光定量儀(如Qubit)評估濃度與純度,確保OD260/280比值介于1.8–2.0。 2. 文庫構建 通過片段化、末端修復、接頭連接及PCR擴增等步驟制備測序文庫,文庫質量需經Agilent 2100生物分析儀或qPCR驗證。 3. 高通量測序 根據目標區域選擇全基因組測序(WGS)、全外顯子組測序(WES)或靶向捕獲測序,測序深度需符合臨床要求(如腫瘤檢測通常需≥500×)。 4. 數據分析與解讀 采用生物信息學工具(如BWA、GATK)進行序列比對、變異注釋及臨床意義分級,最終生成符合指南的檢測報告。

四、核心檢測儀器

NGS技術依賴高精度設備保障檢測效能,常用儀器包括:

  • 測序儀:Illumina NovaSeq 6000、Thermo Fisher Ion GeneStudio S5系列、華大基因MGISEQ-2000。
  • 核酸質控設備:Agilent 2100生物分析儀、Qubit 4.0熒光定量儀。
  • 建庫系統:Beckman Coulter Biomek自動化工作站、PCR擴增儀(如ABI Veriti)。
  • 數據分析平臺:高性能計算集群(HPCC)及專業分析軟件(如CLC Genomics Workbench、Sentieon)。

結語

NGS檢測的標準化實施需從樣本管理、技術操作到數據解讀全程把控。隨著技術迭代與行業規范的完善,NGS將進一步推動精準醫學的發展,為疾病診斷與治療提供更高效的解決方案。


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測試流程

NGS檢測的判斷檢測標準流程

注意事項

1.具體的試驗周期以工程師告知的為準。

2.文章中的圖片或者標準以及具體的試驗方案僅供參考,因為每個樣品和項目都有所不同,所以最終以工程師告知的為準。

3.關于(樣品量)的需求,最好是先咨詢我們的工程師確定,避免不必要的樣品損失。

4.加急試驗周期一般是五個工作日左右,部分樣品有所差異

5.如果對于(NGS檢測的判斷檢測標準)還有什么疑問,可以咨詢我們的工程師為您一一解答。

  • 服務保障 一對一品質服務
  • 定制方案 提供非標定制試驗方案
  • 保密協議 簽訂保密協議,嚴格保護客戶隱私
  • 全國取樣/寄樣 全國上門取樣/寄樣/現場試驗
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